Отчет ИВМ СО РАН за 2008 год

Интеграционные, экспедиционные проекты, гранты СО РАН

• Заказные интеграционные проекты
• Междисциплинарные интеграционные проекты
• Комплексные интеграционные проекты
• Экспедиционные проекты
• Целевая программа СО РАН «СуперЭВМ»
• Целевая программа СО РАН «Информационные и телекоммуникационные ресурсы СО РАН»

Целевая программа СО РАН «СуперЭВМ»

Руководитель: чл.-корр. РАН В. В. Шайдуров

В настоящее время Институт имеет 2 суперкомпьютера кластерной архитектуры. Один из них — МВС-1000/16 (15 вычислительных узлов Pentium III 866 Мгц и 1 управляющий Pentium III 1000Мгц с двухсетевой архитектурой на базе FastEthernet) с пиковой производительностью около 14,0 млрд. оп/сек используется только для учебных целей.

В 2008 году были закончены работы по модернизации второго кластера Института — МВС-1000/ИВМ. В настоящий момент кластер состоит из 48 вычислительных узлов, предоставляющих 96 логических процессоров. Кластер доступен для пользователей по адресу cluster2.krasn.ru по протоколам ssh2 и ftp. Доступ в пределах научно-образовательной сети Красноярска осуществляется по оптоволоконным линиям связи со скоростью 100 Мбит/сек, а доступ из внешней среды по сети СО РАН — 10 Мбит/сек. Производительность модернизированного кластера по результатам теста LINPACK увеличилась более чем в 2 раза и составляет 300 Гфлопс (было 134 Гфлопс). Пиковая производительность составляет 450,8 млрд.оп/сек (было 220.4 млрд.оп/сек).

В ходе модернизации программная архитектура кластера претерпела ряд существенных изменений, призванных повысить производительность и надежность работы системы, а также облегчить администрирование и выполнение ремонтно-диагностических процедур. Помимо удвоения количества логических узлов, практически полностью обновлено системное программное обеспечение кластера, осуществлен переход на бездисковую (сетевую) загрузку узлов, упорядочена и реорганизована политика установки и обновления системных и специализированных библиотек и компиляторов с учетом опыта эксплуатации кластера в 2006–2007 годах. Кроме того, на кластере впервые установлена система DVM версии 3.98. В каталоге «/common/dvm-3.98/demo» размещены демонстрационные материалы, подготовленные авторами системы DVM.

Таким образом, в настоящее время системное программное обеспечение МВС-1000/96 составляют 64-битные версии операционной системы Gentoo linux, компиляторов GNU C/C++ и GNU Fortran, компиляторов Intel C/C++ и Intel Fortran, а также коммуникационные среды — реализации MPI (MPICH1, MPICH2, LAM), система параллельного программирования DVM, специализированные вычислительные пакеты. С учетом произведенных изменений пользователям рекомендовано перекомпилировать для повышения быстродействия свои старые программы. На всех узлах установлены библиотеки вычислительного характера: blas и lapack (оптимизированные), fftw v.2, визуализатор gnuplot.

В связи с увеличением числа узлов была переделана система электроснабжения и бесперебойного питания кластера. Приобретен дополнительный источник бесперебойного питания APC Smart-UPS RM 7500, мощностью 7500 Вт, что обеспечивает работу и безопасное завершение задач при сбоях напряжения в сети на время до 15 минут.

Дополнительно в 2008 году приобретен сервер хранения данных на 3 Терабайта, на который планируется перенести каталоги пользователей, что позволит увеличить скорость доступа к данным и обеспечить их защиту от аппаратных сбоев. Кроме того, приобретен один двухпроцессорный двухядерный модуль, идентичный закупке 2007 года для обеспечения горячего резерва.

МВС-1000/16 в настоящее время используется только для учебных задач, не предполагающих длительных расчетов, а также для проведения спецкурсов по параллельным вычислениям в Сибирском федеральном университете и Красноярском государственном педагогическом университете.

Суперкомпьютер МВС-1000/ИВМ в настоящее время наиболее существенно используется сотрудниками Института физики СО РАН и Института вычислительного моделирования СО РАН.

На всех суперкомпьютерах ведется статистика использования ресурсов и организован телекоммуникационный доступ из сетей общего пользования. В течение 2008 года средняя загрузка всех процессоров кластера МВС-1000/ИВМ за истекший период составила около 69%, что в 1,2 раза больше чем в 2007 году.

За истекший год суммарное время всех процессоров (в минутах) увеличилось в 1,4 раза (с 13441268 до 18977980). Статистика использования МВС-1000/ИВМ для расчетов приведена в следующей таблице.

(Отдел средств телекоммуникаций и вычислительной техники)