ИВМ СО РАН Поиск 
Семинары Института
институт
структура
сотрудники
конференции
семинары
ученый совет
совет молодых ученых
комиссия по РИД
техническая база
история
фотогалерея

исследования
разработки
экспедиции
эл. архив
годовые отчеты

ссылки
библиотека
документы
адреса и телефоны
 

Проблемы математического и численного моделирования

2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 Все ]

Разработка алгоритмов выполнения молекулярного докинга с использованием графических процессоров

вторник, 21 февраля 2017 г., 16:00, каб. 434

Фарков М. А. (СФУ)
(по материалам кандидатской диссертации)

Предложен новый алгоритм выполнения метода дифференциальной эволюции с использованием гетерогенных вычислительных систем, использующих графические процессоры. В отличие от существующих подходов алгоритм использует одноблочную параллельную декомпозицию процедуры оптимизации, что позволяет выполнять несколько процедур оптимизации одновременно на одном графическом процессоре, а также гибко управлять процессом решения задачи.
Предложенный алгоритм выполнения метода дифференциальной эволюции использован для разработки алгоритма выполнения молекулярного лиганд-белкового докинга с использованием графических процессоров, который позволяет ускорить обработку больших баз химических соединений.

Новый метод кластеризации многомерных данных на основе проверки связности взвешенных графов

четверг, 2 февраля 2017 г., 16:00, каб. 434

Садовский М. Г., Остыловский А. Н. (ИМиФИ СФУ)
(научное сообщение)

Предложен метод, позволяющий выделять кластеры в структурах данных, не поддающихся кластеризации линейными методами (например, методом динамических ядер). Метод основан на построении полносвязного графа, вершины которого – точки в (многомерном) пространстве, а рёбра (взвешенные) – расстояния между вершинами в заданной метрике. Кластеризация заключается в последовательном исключении самых «тяжёлых» рёбер и проверке связности получающегося графа. Кластеризация считается оконченной, когда исходный граф теряет связность. Обсуждены как вычислительные аспекты предложенного метода, так и особенности его реализации.

2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 Все ]