Отдел Вычислительной математики

Список публикаций за 2008 год (87)

• Gorban A., Kegl B., Wunch D., Zinovyev A. (eds.) Principal Manifolds for Data Visualization and Dimension Reduction // Lecture Notes in Computational Science and Engineering. — Springer, 2008. — Vol. 58. — 340 p.
• Brownlee R. A., Gorban A. N. Levesley J. Nonequilibrium entropy limiters in lattice Boltzmann methods // Phys. A: Statistical Mechanics and its Applications. — 2008. — Vol. 387. — P. 385–406.
• Gorban A. N., Radulescu O. Dynamic and Static Limitation in Multiscale Reaction Networks // Revisited, Advances in Chemical Engineering. — 2008. — Vol. 34. — P. 103–173.
• Radulescu O., Gorban A. N., Zinovyev A., Lilienbaum A. Robust simplifications of multiscale biochemical networks // BMC Systems Biology. — 2008. — Vol. 2. — article № 86. — 56 p.
• Radulescu O., Gorban A. N., Zinovyev A., Lilienbaum A. Robust simplifications of multiscale biochemical networks // BMC Systems Biology. — 2008. — P. 2-86.
• Белолипецкий В. М., Белолипецкий П. В., Генова С. Н. Прогноз возможных последствий строительства Богучанской ГЭС // Проблемы безопасности и чрезвычайных ситуаций. — 2008. — № 2. — С. 65-69.
• Белолипецкий В. М., Генова С. Н. Численное моделирование годовой динамики вертикальной структуры соленого озера // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 9. — № 4. — С. 34-43.
• Белолипецкий В. М., Генова С. Н. Численные расчеты вертикальных распределений температуры и солености воды в озере Шира // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — Вестник КазНУ им. Аль-Фараби, сер. Математика, механика, информатика. — № 3(58). — Ч. 1. — С. 261–266. (Совместный выпуск).
• Гилева Л. В., Шайдуров В. В. Обоснование сходимости многосеточного каскадного алгоритма для квадратичных конечных элементов в области с гладкой границей // СибЖВМ. — 2008. — Т. 11. — № 4. — С. 301–324.
• Ahnert S. E., Fink T. M.A., Zinovyev A. How much non-coding DNA do eukaryotes require? // J. of Theoretical Biology. — 2008 . — Vol. 252(4). — P. 587–592.
• Calzone L., Gelay A., Zinovyev A., Radvanyi F., Barillot E. A comprehensive modular map of molecular interactions in RB/E2F pathway // Molecular Systems Biology. — 2008. — Vol. 4. — P. 174–178.
• Zinovyev A., Viara E., Calzone L., Barillot E. BiNoM: a Cytoscape plugin for using and analyzing biological networks // Bioinformatics. — 2008. — Vol. 24(6). — P. 876–877.
• Arcidiacono S., Mantzaras J., Karlin I. V. Lattice Boltzmann simulation of catalytic reactions // Phys. Rev. E. — 2008. — Vol. 78. — 046711.
• Bardow, Karlin I. V., Gusev A. Multi-speed models in off-lattice Boltzmann simulations // Phys. Rev. E. — 2008. — Vol. 77. — 025701 (Rapid Communication).
• Chiavazzo E., Karlin I. V. Quasi-equilibrium grid algorithm: Geometric construction for model reduction // J. Computational Physics. — 2008. — Vol. 227. — P. 5535–5560.
• Chiavazzo E., Karlin I. V., Frouzakis C. E., Boulouchos K. B. Method of invariant grid for model reduction of hydrogen combustion // Proc. Combustion Inst. — 2008. — doi:10.1016/j.proci.2008.05.014.
• Chikatamarla S. S., Karlin I. V. Complete Galilean invariant lattice Boltzmann models // Comput. Phys. Commun. — 2008. — Vol. 179. — P. 140–143.
• Karlin I. V., Colangeli M., Kroger M. Exact linear hydrodynamics from the Boltzmann equation // Phys. Rev. Lett. — 2008. -Vol. 100. — 214503.
• Prasianakis N. I., Karlin I. V. Lattice Boltzmann simulation of compressible flows on standard lattices // Phys. Rev. E. — 2008. — Vol. 78. — 016704.
• Yudistiawan W., Ansumali S., Karlin I. V. Hydrodynamics beyond Navier-Stokes: Slip flow model // Phys. Rev. E. — 2008. — Vol. 78. — 016705.
• Denisenko V. V., Kitaev A. V., Biernat H. K. Two dimensional model of magnetic field transfer through the magnetospheric tail due to plasma flow in the plasma sheet // Proc. 7-th Int. Conf. «Problems of Geocosmos». — St. Petersburg: St. Petersburg State University. — 2008. — P. 52-56.
• Denisenko V. V., A. V. Kitaev, H. K. Biernat. Two dimensional model of magnetic field transition through the magnetospheric tail due to plasma stream in the plasma layer // Abstr. 7-th Int. Conf. on Problems of Geocosmos. — St.-Petersburg: St.-Petersburg State University. — 2008. — P. 54.
• Компаниец Л. А., Якубайлик Т. В., Гуревич К. Ю., Гаврилова Т. В., Кирилюк Е. А. Сравнительный анализ двух моделей двухслойной жидкости в приближении Экмана // Журнал Сибирского федерального университета. Математика и физика. — 2008. — Т. 1. — № 2. — С. 197–209.
• Гаврилова Л. В., Компаниец Л. А. Теоретическое и численное исследование ветрового течения жидкости (модель Экмана) // Вычислительные технологии — 2008. — Т. 13. — Вестник КазНУ им. Аль-Фараби, сер. Математика, механика, информатика. — № 3 (58). — Ч. 1. — С. 397–402. (Совместный выпуск).
• Кирилюк Е. А., Компаниец Л. А. Нахождение аналитических решений модели многослойной жидкости экмановского типа с помощью системы MAPLE // Материалы V Всесиб. конгресса женщин-математиков. — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 205–210.
• Компаниец Л. А., Гаврилова Л. В. Точное решение одной модели стационарного движения двухслойной жидкости // Материалы V Всесиб. конгресса женщин-математиков. — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 222–227.
• Гаврилова Л. В., Компаниец Л. А. Многослойная модель ветрового движения жидкости // Тез. междунар. конф. «Современные проблемы математического моделирования и вычислительных технологий — 2008». — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 11.
• Компаниец Л. А. Аналитическое решение задачи ветрового движения жидкости (двумерный и трехмерный случай) // Тез. докл. междунар. конф. «Дифференциальные уравнения. Функциональные пространства. Теория приближений». — Новосибирск: ИМ СО РАН. — 2008. — С. 507.
• Якубайлик Т. В., Компаниец Л. А. Сравнение аналитических решений двух моделей ветрового стационарного движения жидкости в непроточном водоеме // Тез. междунар. конф. «Современные проблемы математического моделирования и вычислительных технологий — 2008». — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 43.
• Denisenko V. V., Biernat H. K., Mezentsev A. V., Shaidurov V. A., Zamay S. S. Modification of conductivity due to acceleration of the ionospheric medium // Annales Geophysicae. — 2008. — Vol. 26. — P. 2111–2130.
• Двинский А. Л., Новиков Е. А. Аппроксимация матрицы Якоби в (m,3)-методах // СибЖВМ. — 2008. — Т. 11. — № 3. — С. 283–295.
• Новиков Е. А. Алгоритм интегрирования переменной структуры для решения жестких задач на основе явного и L-устойчивого методов // Вестник СибГАУ. — 2008. — Вып. 1(18). — С. 75-78.
• Новиков Е. А., Шорников Ю. В. Численное моделирование гибридных систем методом Рунге-Кутта второго порядка точности // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — № 2. — С. 99–105.
• Novikov E. A. (m,2)-Methods Of Accuracy Of A Maximal Order For Stiff Systems // Sixth (6th) Int. Conf. of Numerical Analysis and Applied Mathematics (ICNAAM 2008), Greece. — 2008.
• Вяткин А. В., Новиков Е. А., Шайдуров В. В. Движение диполей под воздействием магнитных сил взаимодействия // Междунар. конф. «Вычислительные и информационные технологии в науке, технике и образовании». — Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — Вестник КазНУ. — № 3(58). — 2008. — С. 389–396.
• Новиков Е. А. Алгоритм на неоднородных схемах второго порядка для решения жестких задач с небольшой точностью // Тр. XIV Байкальской междунар. конф. «Методы оптимизации и их приложения». — 2008. — C. 142–150.
• Новиков Е. А., Пятаев С. Ф. Криптографические методы защиты информации // Метод. указания к самостоятельной работе. — Красноярск: СФУ. — 2008. — 56 с.
• Новиков Е. А., Пятаев С. Ф. Криптографические методы защиты информации // Метод. указания к лабораторным работам. — Красноярск: СФУ. — 2008. — 88 с.
• Новиков Е. А., Шитов Ю. А. Криптографические методы защиты информации // Учеб. пособие. — Красноярск: СФУ. — 2008. — 178 с.
• Рогалев А. Н. Вопросы устойчивости ансамблей дифференциальных уравнений // Вычислительные технологии // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — Вестник КазНУ им. Аль-Фараби, сер. Математика, механика, информатика. — № 4(59). — Ч. 3. — С. 111–117. (Совместный выпуск).
• Рогалев А. Н., Рогалев А. А. Вычисление областей допустимых отклонений динамических систем с помощью параллельных алгоритмов // Тр. междунар. конф. «Параллельные вычисления и задачи управления». — Москва: ИПУ им. Трапезникова РАН. — 2008 — С. 999–1010.
• Рогалев А. Н. Гарантированные границы исследования безопасности и живучести сложных систем // Тез. докл. XII Российс. конф. с междунар. участием «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы». — Новосибирск. — 2008. — С. 26-27.
• Рогалев А. Н. Программное обеспечение для нахождения гарантированных оценок в моделях загрязнения потоков // Тез. докл. XII Российс. конф. с междунар. участием «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы». — Новосибирск. — 2008. — С. 26.
• Kourshakova K. A., Senashova M. Yu. A model of Reflection Behaviour in Biological Communities // J. of Siberian Federal University. Mathematics & Physics. — 2008. — № 1(3). — P. 284–289.
• Рубцов А. Г., Садовский М. Г., Сенашова М. Ю. Восстановление отсутствующих данных и принцип максимального подобия // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — № 3. — С. 114–127.
• Садовский М. Г., Сенашова М. Ю., Куршакова К. А. Простейшая модель пространственного поведения особей, реализующих рефлексивные стратегии // Журнал общей биологии. — 2008. — Т. 69. -№ 6. — С.
• Садовский М. Г., Сенашова М. Ю., Сачивко С. А. Модели оптимизационной миграции глобально информированных особей в случае нескольких стаций // Журнал проблем эволюции открытых систем. — Алматы. — 2008. — Вып. 10. — Т. 2. — C. 291–295.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Куршакова К. А. Рефлексивное поведение и его влияние на динамику численности популяции // Журнал проблем эволюции открытых систем. — Алматы. — 2008. — Вып. 10. — Т. 2. — C. 296–307.
• Брычев П. А., Садовский М. Г., Сенашова М. Ю. Динамика популяции локально информированных особей // Материалы VIII Междунар. науч.-метод. конф. «Информатика: проблемы, методология, технологии». — Воронеж: Воронежский гос. ун-т. — 2008. — C. 81-85.
• Сачивко С. А., Садовский М. Г., Сенашова М. Ю. Модель, оптимизирующая средний по пространству коэффициент размножения, для случая нескольких стаций // Материалы VIII Междунар. науч.-метод. конф. «Информатика: проблемы, методология, технологии». — Воронеж: Воронежский гос. ун-т. — 2008. — С. 209–213.
• Сенашова М. Ю., Куршакова К. А. Моделирование влияния рефлексивного поведения особей на динамику численности популяции // Материалы VIII Междунар. науч.-метод. конф. «Информатика: проблемы, методология, технологии». — Воронеж: Воронежский гос. ун-т. — 2008. — С. 228–232.
• Сенашова М. Ю., Рубцов А. Г. Восстановление отсутствующих данных в символьных последовательностях. Генетические алгоритмы // Материалы VIII Междунар. науч.-метод. конф. «Информатика: проблемы, методология, технологии». — Воронеж: Воронежский гос. ун-т. — 2008. — С. 232–237.
• Куршакова К. А., Сенашова М. Ю. Моделирование рефлексивного поведения в биологических сообществах // Материалы V Всесиб. конгресса женщин-математиков. — Красноярск: СФУ. — 2008. — C. 244–249.
• Садовский М. Г., Сенашова М. Ю., Брычев П. А. Простейшая модель миграции локально информированных особей // Тр. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — Ч. 1. — С. 192–200.
• Садовский М. Г., Сенашова М. Ю., Куршакова К. А. Моделирование рефлексивного поведения // Тр. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — Ч. 2. — С. 191–198.
• Садовский М. Г., Сенашова М. Ю., Сачивко С. А. Оптимизационная модель миграции глобально информированных особей в случае нескольких стаций // Тр. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — Ч. 1. — С. 200–208.
• Сенашова М. Ю., Рубцов А. Г. Восстановление отсутствующих данных в символьных последовательностях с использованием субоптимальных алгоритмов // Материалы XI Всерос. семинара «Моделирование неравновесных систем». — Красноярск: ИВМ СО РАН. — 2008. — С. 170–174.
• Сенашова М. Ю., Рубцов А. Г. Матричное представление частотного словаря в задаче восстановления отсутствующих данных // Материалы V Всесиб. конгресса женщин-математиков. — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 367–372.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Рубцов А. Г. Субоптимальные алгоритмы восстановления отсутствующих данных в символьных последовательностях // Тр. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — Ч. 2. — С. 217–224.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Брычев П. А. Локальная информированность особей в модели оптимизационной миграции // Материалы XI Всерос. семинара «Моделирование неравновесных систем». — Красноярск: ИВМ СО РАН. — 2008. — С. 153–158.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Сачивко С. А. Простейшая модель оптимизационной миграции особей в случае нескольких стаций // Материалы XI Всерос. семинара «Моделирование неравновесных систем». — Красноярск: ИВМ СО РАН. — 2008. — С. 165–169.
• Сенашова М. Ю., Хорев И. С. Нейросетевое предсказание гибели деревьев // Материалы XI Всерос. семинара «Моделирование неравновесных систем». — Красноярск: ИВМ СО РАН. — 2008. — С. 175–176.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Куршакова К. А. Моделирование оптимизационной миграции с рефлексивным поведением // Материалы XI Всерос. семинара «Моделирование неравновесных систем». — Красноярск: ИВМ СО РАН. — 2008. — С. 160–164.
• Sadovsky M. G., Senashova M. Yu., Kourshakova K. A., Brychev P. A., Sachivko S. A. Simple Models of Dynamics of Spatially Distributed Biological Communities with Targeted Migration // Abstr. European Conf. on Mathematical and Theoretical Biology. — Edinburgh. — 2008. — P. 45-47.
• Садовский М. Г., Сенашова М. Ю., Сачивко С. О. Оптимизационная модель миграции в случае нескольких стаций // Тез. докл. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 77-78.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Брычев П. А. Простейшие модели локальной информированности в случае оптимизационной миграции // Тез. докл. X Междунар. науч. конф. «Проблемы эволюции открытых систем». — Алматы: КазНУ. — 2008. — С. 54-55.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Куршакова К. А. Влияние рефлексивного поведения на динамику численности популяции // Тез. докл. X Междунар. науч. конф. «Проблемы эволюции открытых систем». — Алматы: КазНУ. — 2008. — С. 53-54.
• Сенашова М. Ю., Садовский М. Г., Сачивко С. А. Модель оптимизационной миграции для случая нескольких стаций // Тез. докл. X Междунар. науч. конф. «Проблемы эволюции открытых систем». — Алматы: КазНУ. — 2008. — С. 55-56.
• Карепова Е. Д., Федоров Г. А. Моделирование неустановившегося движения воды в нижнем бьефе Богучанской ГЭС // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. (Спец. вып. 2). — С. 28-38.
• Agoshkov V. I., Kamenschikov L. P., Karepova E. D. and Shaidurov V. V. Numerical Solution of Some Direct and Inverse Mathematical Problems for Tidal Flows // Notes on Numerical Fluid Mechanics and Multidisciplinary Design. — Berlin: Springer-Verlag. — 2008. — Vol. 101. — P. 41-54.
• Agoshkov V. I., Kamenshchikov L. P., Karepova E. D. and Shaidurov V. V. Numerical Solution of Some Direct and Inverse Mathematical Problems for Tidal Flows // Computational Science and High Performance Computing III. The 3rd Russian-German Advanced Research Workshop. Berlin: Springer-Verlag. 2008. — P. 31-43.
• Каменщиков Л. П., Карепова Е. Д., Шайдуров В. В. Моделирование распространения крупномасштабных волн в морях и океанах с параллельной реализацией // Тр. IV Сибирской школы-семинара по параллельным и высокопроизводительным вычислениям. — Томск: ТГУ, OOO «Дельтаплан». — 2008. — С. 108–115.
• Popova T., Mennerich D., Weith A., Quast K. Effect of RNA quality on transcript intensity levels in microarray analysis of human post-mortem brain tissues // BMC Genomics. — 2008. — Vol. 9. — P. 91-94.
• Вяткин А. В., Шайдуров В. В., Щепановская Г. И. Метод конечных элементов в моделировании сферически-симметричных пульсаций Земли // Журнал Сибирского федерального университета. Математика и физика. — 2008. — Т. 1. — № 3. — С. 247–256.
• Шайдуров В. В., Щепановская Г. И. Газодинамическая модель внутреннего строения Земли // Вестник СибГАУ. — 2008. — № 1(18). — С. 79-83.
• Vyatkin A. V., Shaidurov V. V., Shchepanovskaya G. I. The numerical spherically symmetric modeling of deep-seated geodynamics // Numerical Analysis and Its Applications. — Springer. — Vol. ??? . — 2008. — P. 11 (в печати).
• Шайдуров В. В., Щепановская Г. И. Компьютерная модель сферически-симметричного внутреннего строения Земли // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — Вестник КазНУ им. Аль-Фараби, сер. Математика, механика, информатика. — № 4(59). — Ч. 3. — С. 324–331. (Совместный выпуск).
• Шайдуров В. В., Щепановская Г. И., Якубович М. В. Об одной аппроксимации многомерного уравнения переноса массы // Материалы ХII Междунар. научн. конф. «Решетневские чтения». — Красноярск: СибГАУ. — 2008. — С. 326.
• Ушакова О. А., Шайдуров В. В., Щепановская Г. И. Математическое моделирование сферически-симметричных пульсаций Земли // Материалы V Всесиб. конгресса женщин-математиков. — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 395–400.
• Шайдуров В. В., Щепановская Г. И. О численной реализации газодинамической сферически-симметричной модели внутреннего строения Земли // Сб. материалов всерос. науч.-техн. конф. «Фундаментальные основы баллистического проектирования». — СПб.: БГТУ. — 2008. — Т. 1. — С. 160–164.
• Садовский М. Г., Мишанина С. М. Нарушение симметрии триплетного состава в кодирующих областях геномов бактерий // Материалы XVI Всерос. семинара «Нейроинформатика, ее приложения и анализ данных». — Красноярск: ИВМ СО РАН. — 2008. — С. 86-90.
• Садовский М. Г., Мишанина С. М. Сравнения последовательностей: комбинаторика vs. статистика // Материалы V Всесиб. конгресса женщин-математиков. — Красноярск: СФУ. — 2008. — C. 305–308.
• Садовский М. Г., Широкова А. И. Особенности потребительского поведения физических лиц на рынке страховых услуг // Тр. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — Ч. 1. — С. 208–214.
• Садовский М. Г., Атрофименко А. В. Некоторые особенности потребительского поведения на рынке финансовых услуг // Тез. докл. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 77-78.
• Садовский М. Г., Коновалова Н. А. О фоновом восприятии рекламы в печатных СМИ // Тез. докл. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 75.
• Садовский М. Г., Широкова А. И. Некоторые особенности потребительского поведения на рынке страховых услуг // Тез. докл. VII Всерос. конф. «Финансово-актуарная математика и смежные вопросы». — Красноярск: СФУ. — 2008. — С. 78-79.
• Белолипецкий В. М., Пискажова Т. В. Тепловая динамическая модель для автоматического управления технологией электролиза алюминия // Вычислительные технологии. — 2008. — Т. 13. — Вестник КазНУ им. Аль-Фараби, сер. Математика, механика, информатика. — № 3(58). — Ч. 1. — С. 267–274. (Совместный выпуск).